La Loire est un fleuve associé à une flore et des habitats naturels particuliers, présents grâce à sa dynamique naturelle préservée. La grande variabilité des milieux implique que la végétation évolue dans le temps et l'espace. Dès sa naissance, le fleuve alimente des tourbières, véritables réservoirs de biodiversité. La Loire et ses affluents accueillent ainsi des espèces animales dépendantes de la bonne qualité de l'eau : truites, chabots, saumons (dans l'Allier), et même des moules perlières.

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